1、科属不同。青占鱼是鲈形目、鲭科、鲐属鱼类。而秋刀鱼是颌针鱼目、竹刀鱼科、秋刀鱼属鱼类，由于其体形修长如刀，生产季节在秋天而得名。

2、体型不同。青占鱼体型粗壮微扁，形状呈纺锤形；而秋刀鱼体型纤细而延长，形状呈棒状。

3、体色不同。青占鱼体背呈青黑色或深蓝色，体侧有不规则的深蓝色虫蚀纹，腹部白而略带黄色，胸鳍浅黑色，臀鳍浅粉红色，其他各鳍为淡黄色；而秋刀鱼体背呈深蓝色，腹部呈银灰色，体侧中央有一银蓝色纵带，胸鳍浅灰色，臀鳍和腹鳍白色，背鳍及小鳍、尾鳍为灰褐色。

4、牙齿不同。青占鱼口大，上下颌等长，各具一行细牙，犁骨和跨骨有牙；而秋刀鱼下颌稍长于上颌，两颌齿细弱，排列成一行，犁骨、腭骨、舌上无齿。